BlastX コマンド

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コマンド名	BlastX
タイトル	Blsic Local Alignment and Search Tool
説明	Search protein database using a translated nucleotide query
スクリーンショット
URL	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi?PAGE=Translations&PROGRAM=blastx&BLAST_PROGRAMS=blastx&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
カテゴリ	Web検索
アクセス数	30
登録日	2008-06-27
スタンド	cyberlink
タイプ	Webサイト
アイコンURL
文字エンコーディング	UTF-8
メソッド	GET
	戻るコマンドのコピー別名でコマンドを登録

オプション

No	オプション名	タイトル	デフォルト値
1
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8
9
10

Ubiquity用エクスポート

CmdUtils.CreateCommand({
  name: "BlastX",
  description: "Blsic Local Alignment and Search Tool",
  help: "Search protein database using a translated nucleotide query",
  query_url: "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi?PAGE=Translations&PROGRAM=blastx&BLAST_PROGRAMS=blastx&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on",
  icon: "",
  stand: "cyberlink",
  takes: {parameter: noun_arb_text},

_getQuery: function(directObject) {
    var query = this.name;
    if (directObject.text != "")
      query += " " + directObject.text;
    return encodeURI(query);
  },

preview: function( pblock, directObject ) {
    var shot_url = "http://mozshot.nemui.org/shot?";
    var img_url = "<img src='" + shot_url + this.query_url + "'/>";
    var help = "<p>" + this.help + "</p>";
    pblock.innerHTML = help + img_url;
  },

execute: function(directObject) {
    var url = "http://www.startcommand.com/stand/" + this.stand + "?cmd={QUERY}";
    var query = this._getQuery(directObject);
    var urlString = url.replace("{QUERY}", query);
    Utils.openUrlInBrowser(urlString);
  }
})